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患者所掛科室應依所患疾病而定，選擇什么樣磁共振檢查由臨床醫師做出選擇。每一位患者到臨床就醫時，可能是有目的性，可能想做磁共振檢查，但是在選擇做磁共振檢查之前，應該讓臨床醫師進行簡單的臨床判斷，繼而進行有效而準確的磁共振檢查選擇，才能有效達到臨床診斷和治療目的。例如一位患者以腹痛、腹脹、腹部不適來醫院就診，患者也許想做磁共振檢查，因為磁共振檢查安全無創，但醫生依然建議患者首先選擇臨床醫生進行簡單鑒別后，再選擇是否行磁共振檢查，因為磁共振檢查并不能解決所有臨床問題和需求。患者也可以到CT磁共振科進行咨詢，會得到更專業性的指導性意見，幫助患者進行有效的磁共振檢查。