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病毒性發燒與細菌性發燒不易從癥狀上進行鑒別，兩者均可出現低燒或高燒，均表現為持續性發燒或間歇性發燒，同時伴隨身體各處病變。患者通常需進行更多檢查以明確病因，可以進行血常規檢測，因為細菌引起的發燒通常白細胞較多，且以中性粒細胞為主，而病毒感染導致發燒時，患者的白細胞甚至會降低。通過血常規檢查鑒別病毒感染或細菌感染可能并不準確，某些特殊病毒也可導致白細胞增高，但多數情況下可以通過血常規進行粗略的判斷。除血常規外，患者還可以檢測細菌感染的標志物，以及病毒感染的抗原、抗體，也可進行血液培養以觀察是否存在細菌。