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導致胎兒畸形的原因較多，常見原因如下：一、內在因素：1、胎兒自身發育異常：如染色體異常，目前可以通過相關檢測進行篩查，如羊水穿刺、絨毛穿刺或臍血穿刺，作為相關染色體或基因方面的檢查，還可以通過超聲，對胎兒進行結構上的判斷，如唇裂、先心病或腎臟畸形等一系列問題，都可通過超聲檢查發現；2、遺傳因素：有可能會導致胎兒畸形；3、母體因素：孕婦的年齡、精子和卵子的質量。二、外界因素：1、理化因素：有害的物理環境、化學環境，可能會導致胎兒染色體或基因突變，從而造成胎兒畸形；2、藥物因素：部分藥物有可能導致胎兒的畸形。胎兒畸形是多因素、多通路，多基質導致的病變，胎兒畸形的原因，通常是多種原因共同導致的結構或基因的變化。